Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL23P62829 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL23P62829 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL23P62829 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL23P62829 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL23P62829 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms