Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO4P61968 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMO4P61968 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMO4P61968 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO4P61968 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO4P61968 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMO4P61968 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMO4P61968 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms