Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EIF4A1P60842 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms