Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVFC1P60507 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVFC1P60507 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms