Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RIPPLY3P57055 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIPPLY3P57055 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms