Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN8P56748 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN8P56748 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms