Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP1P56182 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP1P56182 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP1P56182 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP1P56182 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP1P56182 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP1P56182 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms