Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GBX2P52951 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GBX2P52951 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBX2P52951 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBX2P52951 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms