Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2A2P52657 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2A2P52657 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms