Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2A1P52655 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2A1P52655 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms