Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK4P51957 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK4P51957 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK4P51957 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK4P51957 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK4P51957 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK4P51957 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEK4P51957 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK4P51957 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK4P51957 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms