Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLCSP50747 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLCSP50747 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLCSP50747 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HLCSP50747 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HLCSP50747 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLCSP50747 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms