Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM25P49756 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBM25P49756 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM25P49756 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM25P49756 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM25P49756 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM25P49756 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM25P49756 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM25P49756 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM25P49756 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM25P49756 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM25P49756 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM25P49756 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM25P49756 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM25P49756 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM25P49756 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms