Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARSP49589 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARSP49589 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARSP49589 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARSP49589 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARSP49589 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARSP49589 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARSP49589 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARSP49589 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms