Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms