Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRIP1P48552 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms