Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP13P45452 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP13P45452 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP13P45452 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP13P45452 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP13P45452 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP13P45452 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP13P45452 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP13P45452 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP13P45452 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP13P45452 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP13P45452 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP13P45452 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms