Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR1P43307 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR1P43307 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSR1P43307 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms