Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTHFRP42898 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms