Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPA9P38646 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms