Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN2P35609 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms