Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA6P23229 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA6P23229 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms