Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5AP20339 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5AP20339 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms