Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRAP18433 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRAP18433 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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