Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRAFP15056 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRAFP15056 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRAFP15056 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRAFP15056 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRAFP15056 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRAFP15056 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRAFP15056 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms