Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPBP14678 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPBP14678 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms