Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRF1P14222 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRF1P14222 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRF1P14222 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRF1P14222 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRF1P14222 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRF1P14222 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRF1P14222 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRF1P14222 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms