Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCP1P13796 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LCP1P13796 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCP1P13796 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCP1P13796 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCP1P13796 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms