Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRG2P13727 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRG2P13727 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRG2P13727 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRG2P13727 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRG2P13727 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRG2P13727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRG2P13727 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRG2P13727 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRG2P13727 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms