Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGAMP11215 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAMP11215 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms