Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR2F1P10589 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NR2F1P10589 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms