Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GLI4P10075 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GLI4P10075 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLI4P10075 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLI4P10075 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GLI4P10075 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GLI4P10075 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GLI4P10075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms