Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2P0DI81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2P0DI81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms