Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF888P0CJ79 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF888P0CJ79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms