Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB1P08034 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB1P08034 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB1P08034 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB1P08034 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB1P08034 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB1P08034 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB1P08034 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms