Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOA1P02647 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOA1P02647 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOA1P02647 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOA1P02647 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOA1P02647 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOA1P02647 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOA1P02647 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOA1P02647 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms