Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TJP3O95049 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TJP3O95049 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TJP3O95049 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TJP3O95049 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TJP3O95049 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TJP3O95049 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TJP3O95049 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TJP3O95049 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms