Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKAP2O75563 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKAP2O75563 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKAP2O75563 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP2O75563 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms