Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGR5O75473 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGR5O75473 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGR5O75473 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGR5O75473 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGR5O75473 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGR5O75473 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms