Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA2O75334 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA2O75334 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms