Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRD4O60885 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRD4O60885 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRD4O60885 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRD4O60885 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRD4O60885 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRD4O60885 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRD4O60885 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRD4O60885 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRD4O60885 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms