Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK2O60296 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAK2O60296 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK2O60296 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms