Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR1O43759 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR1O43759 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms