Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYNJ2O15056 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYNJ2O15056 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms