Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLRMTO00411 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLRMTO00411 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms