Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H7C1D1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H7C1D1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H7C1D1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H7C1D1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H7C1D1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
H7C1D1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H7C1D1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H7C1D1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H7C1D1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H7C1D1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H7C1D1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H7C1D1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H7C1D1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H7C1D1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H7C1D1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
H7C1D1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms