Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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