Protein–RNA interactions for Protein: H0Y858

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0Y858 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H0Y858 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H0Y858 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H0Y858 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H0Y858 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H0Y858 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
H0Y858 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H0Y858 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H0Y858 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H0Y858 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H0Y858 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms