Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4E1Z4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4E1Z4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4E1Z4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4E1Z4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4E1Z4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4E1Z4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4E1Z4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms