Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD1CA8MV81 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD1CA8MV81 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms