Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC169A6NNP5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC169A6NNP5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms